RealFeedApp Метод k-mer выявляет низкосагнутые спутники у приматов
Новый метод обнаружил специфические для подгенома повторные элементы в гетерохроматине allotetraploid Xenopus laevis, что опровергает модель эктопической рекомбинации, действующую у приматов.
- Область
- генетика и геном
- Что сделали
- Учёные разработали алгоритм на основе k-меров для обнаружения специфических регионов генома, богатых повторными последовательностями, у разных видов тетрапод. Применение метода к геному Xenopus laevis показало наличие древних повторяющихся элементов, возникших у предков этого вида.
- Зачем это
- Это позволяет проверить гипотезу о том, что у тетрапод повторные последовательности передаются иначе, чем у приматов, и понять эволюцию их генома.
#k-mer#heterochromatin#xenopus laevis#genome sequencing#subterminal satellites
