RealFeedApp beta
Генетика и геном
Генетика и геномика: что исследования ДНК рассказывают о наследственности, болезнях и эволюции.
- Инженерная бактерия AS109 работает в 10 семействах растений
Исследователи создали штамм бактерии Rhizobium rhizogenes AS109, который позволяет проводить быстрые тесты экспрессии генов у растений из 14 семейств, включая фасоль и рис, превосходя стандартные методы на основе Agrobacterium.
- При высокой концентрации дигитальная ПЦР использует статистику Пуассона
Технология Countable Labs разделяет образцы на капли, но при превышении порога концентрации статистика Poisson заменяет прямой подсчёт молекул.
- CRISPR подтвердил роль HS2 в супер-энхансере бета-глобина
Новая система Borzoi-SE на основе трансформера предсказала иерархию супер-активаторов в 90 линиях клеток, определив гиперактивный сайт 2 как доминирующий элемент.
- PrimeStack интегрирует фрагменты ДНК в геном риса с точностью 45%
Новая платформа PrimeStack использует редакторы PE и интеграз Bxb1 для точной интеграции крупных ДНК-последовательностей в геном риса без разрыва ДНК. Эффективность целевой вставки достигла 45% по данным ПЦР.
- CRISPR/Cas9-редактирование AF-2 домена BmERR
Удаление домена активации AF-2 у рецептора BmERR в шелкопряке подавило экспрессию генов синтеза меланина. Это подтвердило, что для регуляции метаболизма у насекомых необходим коактиватор.
- За 5900 лет в Дании произошло два почти полных смены населения
Анализ ДНК подтвердил, что прибытие земледельцев привело к полному исчезновению местного населения за короткое время. Исследование, опубликованное в Nature, основано на анализе скелетов и зубов предков из Дании.
- Droplet-MT объединяет транскриптому и метилому на 10 000 клеток
Новый метод объединяет транскриптомику и метилирование для анализа ~21 000 клеток, выявляя клоны в здоровой крови и лейкозе. Методика использует эпимутации для восстановления родословной без дополнительных геномных данных.
- Геном Scirtothrips dorsalis собран на уровне хромосом
Ученые представили хромосомный уровень сборки генома Scirtothrips dorsalis. Сборка включает 20 557 гена и 28,8% повторяющихся элементов.
- Система CONCORD записала 45 689 бит данных в ДНК
Исследователи создали платформу CONCORD, объединяющую конъюгацию и редактирование оснований для записи данных в живых клетках. Система успешно закодировала 45 689 бит информации, включая фрагменты из миссий NASA.
- Система DNA Typewriter показала историю развития эмбриона
Команда во главе с Джей Shendure и Chengxiang Qiu разработала технологию ДНК-печатник для восстановления родословных клеток. Исследование, опубликованное в Science и Cell, дает высокое разрешение для млекопитающего развития.
- PepRePs снижают фосфорилирование белков
Исследователи создали PepRePs — систему, объединяющую пептидный связывающий элемент и серин/треонин-фосфатазу для локализации активности. Дизайн пептидов был проведён с помощью языковых моделей, что позволило эффективно снижать фосфорилирование белков-мишеней, включая тау-белок.
