RealFeedApp Нейросеть ChAI-Net выявила регуляторный код для совместного доступа хроматина
Исследователи обучили модель предсказывать карты совместного доступа хроматина на основе последовательности ДНК. ChAI-Net обнаружила уникальные комбинации мотивов последовательности, управляющие доступностью энхансеров, промоторов и сайтов связывания CTCF.
- Область
- генетика и геном
- Что сделали
- Исследователи разработали нейросеть ChAI-Net, которая предсказывает, как участки ДНК одновременно доступны для белков, анализируя последовательности генома мыши.
- Зачем это
- Это позволяет понять, как комбинации последовательностей мотивов управляют доступностью хроматина в регуляторных элементах, что важно для определения функции и идентичности клеток.
#chromatin#deep learning#single-molecule footprinting#cis-regulatory elements#mouse embryonic stem cells
